MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015850	CGAC	2	8	119066	119073	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2502	NC_015850	CAAT	2	8	119099	119106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_015850	CAC	2	6	119143	119148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_015850	GAAA	2	8	119193	119200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_015850	T	6	6	119275	119280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_015850	AGA	2	6	119396	119401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_015850	ACAGC	2	10	119416	119425	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2508	NC_015850	GAT	2	6	119534	119539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_015850	GCT	2	6	119601	119606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780853
2510	NC_015850	CCATG	2	10	119679	119688	20 %	20 %	20 %	40 %	340780853
2511	NC_015850	CCTT	2	8	119720	119727	0 %	50 %	0 %	50 %	340780853
2512	NC_015850	T	6	6	119798	119803	0 %	100 %	0 %	0 %	340780853
2513	NC_015850	AAG	2	6	119807	119812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780853
2514	NC_015850	TGT	2	6	119861	119866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780853
2515	NC_015850	GCT	2	6	120192	120197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780854
2516	NC_015850	CAG	2	6	120337	120342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780854
2517	NC_015850	GCC	2	6	120360	120365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780854
2518	NC_015850	AGT	2	6	120395	120400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780854
2519	NC_015850	CAC	2	6	120415	120420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780854
2520	NC_015850	CTG	2	6	120585	120590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780854
2521	NC_015850	TGGG	2	8	120599	120606	0 %	25 %	75 %	0 %	340780854
2522	NC_015850	TCA	2	6	120614	120619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780854
2523	NC_015850	TGA	2	6	120660	120665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780854
2524	NC_015850	CTTTT	2	10	120709	120718	0 %	80 %	0 %	20 %	340780854
2525	NC_015850	ATGAC	2	10	120744	120753	40 %	20 %	20 %	20 %	340780854
2526	NC_015850	GTC	2	6	120778	120783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_015850	TCG	2	6	120803	120808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780855
2528	NC_015850	GGC	2	6	120880	120885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780855
2529	NC_015850	ATGG	2	8	120991	120998	25 %	25 %	50 %	0 %	340780855
2530	NC_015850	GGC	2	6	121002	121007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780855
2531	NC_015850	AGC	2	6	121043	121048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780855
2532	NC_015850	ATGC	2	8	121165	121172	25 %	25 %	25 %	25 %	340780855
2533	NC_015850	GGC	2	6	121348	121353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780855
2534	NC_015850	GAT	2	6	121384	121389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780855
2535	NC_015850	GTC	2	6	121411	121416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780855
2536	NC_015850	TGC	2	6	121452	121457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780855
2537	NC_015850	GCA	2	6	121458	121463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780855
2538	NC_015850	AAT	2	6	121496	121501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340780855
2539	NC_015850	AGGAT	2	10	121656	121665	40 %	20 %	40 %	0 %	340780855
2540	NC_015850	ACG	2	6	121693	121698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_015850	AG	3	6	121770	121775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_015850	GC	3	6	121838	121843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2543	NC_015850	TTC	2	6	121848	121853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_015850	CAA	2	6	121917	121922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780856
2545	NC_015850	TGC	2	6	121923	121928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780856
2546	NC_015850	ATG	2	6	122222	122227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780857
2547	NC_015850	CGC	2	6	122275	122280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2548	NC_015850	GGA	2	6	122290	122295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_015850	CCGA	2	8	122303	122310	25 %	0 %	25 %	50 %	340780858
2550	NC_015850	GCT	2	6	122338	122343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780858
2551	NC_015850	TGG	2	6	122388	122393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780858
2552	NC_015850	CGG	2	6	122426	122431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780858
2553	NC_015850	GC	3	6	122437	122442	0 %	0 %	50 %	50 %	340780858
2554	NC_015850	GCG	2	6	122504	122509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780858
2555	NC_015850	TTTTA	2	10	122512	122521	20 %	80 %	0 %	0 %	340780858
2556	NC_015850	T	7	7	122545	122551	0 %	100 %	0 %	0 %	340780858
2557	NC_015850	GAT	2	6	122562	122567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780858
2558	NC_015850	TAT	2	6	122621	122626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_015850	AAT	2	6	122678	122683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_015850	CTT	2	6	122767	122772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_015850	ATC	2	6	122900	122905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_015850	GTC	2	6	122909	122914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_015850	CAGT	2	8	122938	122945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2564	NC_015850	GCC	2	6	122958	122963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_015850	CTG	2	6	122968	122973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_015850	TTG	2	6	122986	122991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_015850	TGC	2	6	123016	123021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_015850	CAA	2	6	123036	123041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_015850	GCTT	2	8	123135	123142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2570	NC_015850	CCCA	2	8	123189	123196	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2571	NC_015850	CCG	2	6	123271	123276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780859
2572	NC_015850	TGC	2	6	123281	123286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780859
2573	NC_015850	CGG	2	6	123290	123295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780859
2574	NC_015850	GCC	2	6	123309	123314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780859
2575	NC_015850	ATG	2	6	123341	123346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780859
2576	NC_015850	ATG	2	6	123399	123404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_015850	TGA	2	6	123475	123480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_015850	CT	3	6	123511	123516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2579	NC_015850	CTT	2	6	123553	123558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_015850	TTC	2	6	123585	123590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_015850	CAC	2	6	123637	123642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2582	NC_015850	GTG	2	6	123650	123655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_015850	GGC	2	6	123706	123711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_015850	CTG	2	6	123841	123846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780860
2585	NC_015850	CCCGC	2	10	123880	123889	0 %	0 %	20 %	80 %	340780860
2586	NC_015850	TGT	2	6	123900	123905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780860
2587	NC_015850	GGGC	2	8	124051	124058	0 %	0 %	75 %	25 %	340780860
2588	NC_015850	CAGT	2	8	124064	124071	25 %	25 %	25 %	25 %	340780860
2589	NC_015850	GCT	2	6	124072	124077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780860
2590	NC_015850	GCCA	2	8	124104	124111	25 %	0 %	25 %	50 %	340780860
2591	NC_015850	TGGG	2	8	124163	124170	0 %	25 %	75 %	0 %	340780860
2592	NC_015850	CCT	2	6	124188	124193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780860
2593	NC_015850	CCA	2	6	124276	124281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780860
2594	NC_015850	CGG	2	6	124321	124326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780860
2595	NC_015850	TCG	2	6	124345	124350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780860
2596	NC_015850	TCC	2	6	124364	124369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780860
2597	NC_015850	GTA	2	6	124377	124382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780860
2598	NC_015850	GGT	2	6	124393	124398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780861
2599	NC_015850	GGT	3	9	124408	124416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780861
2600	NC_015850	GGA	2	6	124420	124425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780861
2601	NC_015850	GTG	2	6	124448	124453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780861
2602	NC_015850	CTC	2	6	124469	124474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780861
2603	NC_015850	GGC	2	6	124486	124491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780861
2604	NC_015850	AAC	2	6	124508	124513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780861
2605	NC_015850	GAG	2	6	124536	124541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_015850	GC	3	6	124674	124679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_015850	ACGCTG	2	12	124704	124715	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_015850	CT	3	6	124740	124745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2609	NC_015850	CGCC	2	8	124752	124759	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2610	NC_015850	CCT	2	6	124798	124803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2611	NC_015850	CG	3	6	124864	124869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2612	NC_015850	CTG	2	6	124870	124875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_015850	AGA	2	6	124898	124903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_015850	TGC	2	6	124953	124958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_015850	AAGG	2	8	125156	125163	50 %	0 %	50 %	0 %	340780862
2616	NC_015850	GTT	2	6	125242	125247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780863
2617	NC_015850	ATTG	2	8	125254	125261	25 %	50 %	25 %	0 %	340780863
2618	NC_015850	GCT	2	6	125276	125281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780863
2619	NC_015850	ACCA	2	8	125354	125361	50 %	0 %	0 %	50 %	340780863
2620	NC_015850	CGG	2	6	125377	125382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780863
2621	NC_015850	CCAT	2	8	125440	125447	25 %	25 %	0 %	50 %	340780863
2622	NC_015850	GGT	2	6	125633	125638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780863
2623	NC_015850	CGC	2	6	125644	125649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780863
2624	NC_015850	G	6	6	125695	125700	0 %	0 %	100 %	0 %	340780863
2625	NC_015850	CTG	2	6	125762	125767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780863
2626	NC_015850	TAT	2	6	125786	125791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340780863
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2753	NC_015850	TCT	2	6	131932	131937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780871
2754	NC_015850	TCA	2	6	131946	131951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780871
2755	NC_015850	TCC	2	6	131961	131966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780871
2756	NC_015850	GGC	2	6	132003	132008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780871
2757	NC_015850	CT	3	6	132024	132029	0 %	50 %	0 %	50 %	340780871
2758	NC_015850	TCA	2	6	132033	132038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780871
2759	NC_015850	TGC	2	6	132042	132047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780871
2760	NC_015850	GCA	2	6	132106	132111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780871
2761	NC_015850	T	7	7	132207	132213	0 %	100 %	0 %	0 %	340780871
2762	NC_015850	TCT	2	6	132315	132320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780871
2763	NC_015850	CGA	2	6	132333	132338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780871
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2765	NC_015850	GGGT	2	8	132500	132507	0 %	25 %	75 %	0 %	340780871
2766	NC_015850	GGC	2	6	132613	132618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780871
2767	NC_015850	ACC	2	6	132690	132695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780871
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2769	NC_015850	GT	3	6	132884	132889	0 %	50 %	50 %	0 %	340780871
2770	NC_015850	TGCT	2	8	132912	132919	0 %	50 %	25 %	25 %	340780871
2771	NC_015850	GCC	2	6	132928	132933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780871
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2774	NC_015850	GTT	2	6	133011	133016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780871
2775	NC_015850	ATG	2	6	133056	133061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2776	NC_015850	GAG	2	6	133107	133112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2777	NC_015850	T	6	6	133169	133174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2778	NC_015850	TGG	2	6	133235	133240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2779	NC_015850	GCA	2	6	133252	133257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2780	NC_015850	GAT	2	6	133268	133273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780872
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2785	NC_015850	TCC	2	6	133445	133450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780872
2786	NC_015850	TGG	2	6	133480	133485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780872
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2792	NC_015850	ATGCC	2	10	133780	133789	20 %	20 %	20 %	40 %	340780872
2793	NC_015850	AAG	2	6	133845	133850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780872
2794	NC_015850	ATTC	2	8	133907	133914	25 %	50 %	0 %	25 %	340780872
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2804	NC_015850	A	6	6	134318	134323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2805	NC_015850	ACA	2	6	134328	134333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2806	NC_015850	CGG	2	6	134372	134377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2807	NC_015850	TTC	2	6	134380	134385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2808	NC_015850	CTTG	2	8	134522	134529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2809	NC_015850	CGA	2	6	134575	134580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2810	NC_015850	CGCA	2	8	134672	134679	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2811	NC_015850	TCA	2	6	134688	134693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2812	NC_015850	TGCT	2	8	134789	134796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2813	NC_015850	AGA	2	6	134811	134816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2814	NC_015850	ACC	2	6	134852	134857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780873
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2820	NC_015850	CAT	2	6	135265	135270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780873
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2836	NC_015850	AATC	2	8	135940	135947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2837	NC_015850	TGGGA	2	10	135965	135974	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2838	NC_015850	CAC	2	6	135991	135996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2839	NC_015850	TGC	2	6	136028	136033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780874
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2843	NC_015850	CG	3	6	136188	136193	0 %	0 %	50 %	50 %	340780874
2844	NC_015850	GCCT	2	8	136201	136208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2845	NC_015850	GAC	2	6	136212	136217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2846	NC_015850	CAT	2	6	136274	136279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780875
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2858	NC_015850	GCA	2	6	136857	136862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780875
2859	NC_015850	GCA	2	6	136935	136940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780875
2860	NC_015850	CATC	2	8	137031	137038	25 %	25 %	0 %	50 %	340780875
2861	NC_015850	CGC	2	6	137075	137080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780875
2862	NC_015850	GCT	2	6	137137	137142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2863	NC_015850	GA	3	6	137215	137220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2864	NC_015850	CG	3	6	137268	137273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2865	NC_015850	CGC	2	6	137377	137382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2866	NC_015850	TTG	2	6	137427	137432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2867	NC_015850	GAA	2	6	137456	137461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2868	NC_015850	GTC	2	6	137487	137492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2869	NC_015850	CTT	2	6	137536	137541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2870	NC_015850	CGA	2	6	137592	137597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2871	NC_015850	CAC	2	6	137623	137628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2872	NC_015850	ACG	2	6	137742	137747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2873	NC_015850	ACG	2	6	137777	137782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2874	NC_015850	TCA	2	6	137918	137923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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